特殊捜査研究所に身を寄せ事件の謎を追う山西だったが、伊万里（北見）の手によって新たな生贄へと落ちてしまう。一方、高城にも新たな危機が近づいていた。ジョディーと共に闇の中で蠢く二つの影！伊万里が…！ジョディーが…！高城が…！過去の出来事が、現在（いま）波紋となってぶつかり合う。伝説的大ヒットアニメ「Bible Black」の新シリーズがクライマックスに向け闇の深淵へと扉を開いていく。